News - Հետազոտողները քարտեզագրում են ավելի քան 50 կենդանիների տեսակների գենոմները՝ ստեղծելով «էվոլյուցիոն ժամանակի մեքենա»

Հետազոտողները հենց նոր քարտեզագրեցին և հրապարակեցին 51 կենդանատեսակների գենոմը՝ ձկներ ուտող կոկորդիլոսներից, որոնք հայտնի են որպես ղարիալներ (Gavialis gangeticus) մինչև կատաղի ամպային հովազներ (Neofelis nebulosa): Այս գենետիկական նախագծերը կարող են լայն ազդեցություն ունենալ մարդկանց համար, մասնավորապես՝ մեր էվոլյուցիոն պատմությունը հասկանալու համար, ասվում է Nature Biotechnology ամսագրում հրապարակված հոդվածում, հաղորդում է Live Science-ը: Հետազոտողների նպատակն է հաջորդականացնել առնվազն մեկ տեսակի գենոմը ողնաշարավորների բոլոր 275 կարգերում: «Որոշ առումով մենք կառուցում ենք էվոլյուցիոն ժամանակի մեքենա», - ասում է հետազոտության համահեղինակ, Ջոն Հոփկինսի համալսարանի համակարգչային գիտության և կենսաբանության պրոֆեսոր Մայքլ Շատցը: «Մեր էվոլյուցիոն զարմիկների գեների քարտեզագրումը կօգնի մեզ ավելի լավ հասկանալ ինքներս մեզ»: Բոլոր կաթնասուններն ունեն ընդհանուր նախահայր, որը, շատ գիտնականների կարծիքով, Մորգանուկոդոնն է՝ փոքրիկ, խորամանկ արարած, որն ապրել է ավելի քան 200 միլիոն տարի առաջ, թեև ոմանք հակառակն են ասում: Ամեն դեպքում, այս ընդհանուր նախահայրը նշանակում է, որ մեր գենետիկական կառուցվածքի մեծ մասը նման է այլ կաթնասունների, մասնավորապես շիմպանզեների, որոնք կիսում են մեր ԴՆԹ-ի մինչև 99%-ը: Մարդկանց և այլ կենդանիների ԴՆԹ-ն համեմատելով՝ հետազոտողները կարող են իմանալ, թե երբ և ինչպես են մարդիկ տարբերվում այլ տեսակներից: Սակայն ողնաշարավորների մեկ գենոմը կարող է ունենալ միլիարդավոր նիշեր, և հետազոտողները պետք է օգտագործեն տարբեր գործիքներ՝ այս գենետիկական նյութը մասերի բաժանելու համար, նախքան այն ամբողջական պատկերը կազմելը: Արդյունքում, գենոմների քարտեզագրումը պատմականորեն ծանր գործընթաց է եղել. 1990 թվականից սկսած՝ հետազոտողներին պահանջվել է 13 տարի՝ մարդկանց համար առաջին գենետիկական նախագիծը ստեղծելու համար: Այնուամենայնիվ, ԴՆԹ-ի քարտեզագրման տեխնոլոգիան տարբեր տեսակների համար արագորեն առաջադիմել է վերջին մի քանի տասնամյակների ընթացքում, և այս նոր նախագիծը ևս մեկ քայլ է նշում՝ կրճատելով հաջորդականության ժամանակը տարիներից և ամիսներից մինչև ընդամենը օրեր: Դա անելու համար թիմն օգտագործել է երկու նախագծերի հետազոտություններ՝ ողնաշարավորների գենոմների նախագիծը և եվրոպական տեղեկատու գենոմի ատլասը: Դրանցից նրանք մշակեցին ալգորիթմներ և համակարգչային ծրագրեր՝ կարճ գենետիկ հատվածները ամբողջական գենետիկ քարտեզի մեջ հավաքելու համար, և, ի վերջո, փորձարկեցին, թե որքան լավ է նրանց աշխատանքային հոսքը վերարտադրում զեբրային ֆինչի (Taeniopygia guttata) ամբողջական գենոմը, որը նախկինում հրապարակվել էր: