News - Дослідники відображають геноми понад 50 видів тварин, створивши «еволюційну машину часу»

Дослідники щойно нанесли на карту та опублікували геноми 51 виду тварин, від рибоїдних крокодилів, відомих як гаріали (Gavialis gangeticus), до лютих хмарних леопардів (Neofelis nebulosa). Згідно зі статтею, опублікованою в журналі Nature Biotechnology, повідомляє Live Science, ці генетичні плани можуть мати широке значення для людини, зокрема для розуміння нашої еволюційної історії. Метою дослідників є секвенування геномів принаймні одного виду в усіх 275 рядах хребетних. «У певному сенсі ми створюємо еволюційну машину часу», — сказав співавтор дослідження Майкл Шатц, професор інформатики та біології в Університеті Джона Хопкінса. «Визначення генів наших еволюційних двоюрідних братів допоможе нам краще зрозуміти себе». Усі ссавці мають спільного предка, яким, на думку багатьох вчених, був Морганукодон, крихітна, схожа на землерийку істота, яка жила понад 200 мільйонів років тому, хоча деякі стверджують протилежне. У будь-якому випадку цей спільний предок означає, що значна частина нашої генетичної структури схожа на таку інших ссавців, зокрема шимпанзе, які мають до 99% нашої ДНК. Порівнюючи ДНК людини та інших тварин, дослідники можуть дізнатися, коли і як люди відокремилися від інших видів. Але геном одного хребетного може мати мільярди символів, і дослідники повинні використовувати різні інструменти, щоб розбити цей генетичний матеріал на частини, перш ніж складати його в повну картину. Як наслідок, картування геномів історично було кропітким процесом: починаючи з 1990 року дослідникам знадобилося 13 років, щоб створити перший генетичний проект для людини. Однак за останні кілька десятиліть технологія картування ДНК для різних видів швидко просунулася вперед, і цей новий проект знаменує собою ще один крок, скорочуючи час секвенування з років і місяців до лише днів. Для цього команда використала дослідження двох проектів: Vertebrate Genomes Project і European Reference Genome Atlas. На основі цього вони розробили алгоритми та комп’ютерне програмне забезпечення для складання коротких генетичних сегментів у повну генетичну карту, і зрештою перевірили, наскільки добре їхній робочий процес відтворює повний геном зебрового в’юрка (Taeniopygia guttata), який був опублікований раніше.