News - محققان با ساخت "ماشین زمان تکاملی" ژنوم بیش از 50 گونه جانوری را نقشه برداری می کنند.

محققان به تازگی ژنوم 51 گونه جانوری، از تمساح ماهی خوار معروف به غاریال (Gavialis gangeticus) گرفته تا پلنگ ابری درنده (Neofelis nebulosa) را نقشه برداری و منتشر کردند. بر اساس مقاله‌ای که در مجله Nature Biotechnology منتشر شده است، این نقشه‌های ژنتیکی می‌توانند پیامدهای گسترده‌ای برای انسان‌ها، به ویژه برای درک تاریخ تکامل ما داشته باشند. هدف محققان تعیین توالی ژنوم حداقل یک گونه در تمام ۲۷۵ راسته مهره‌داران است. مایکل شاتز، یکی از نویسندگان این مطالعه، استاد علوم کامپیوتر و زیست شناسی در دانشگاه جان هاپکینز، در بیانیه ای گفت: «از برخی جهات، ما در حال ساخت یک ماشین زمان تکاملی هستیم. نقشه برداری از ژن های پسرعموهای تکاملی ما به ما کمک می کند تا خودمان را بهتر بشناسیم.» همه پستانداران جد مشترکی دارند، که بسیاری از دانشمندان معتقدند مورگانوکدون است، موجودی ریز و شبیه زیرک که بیش از 200 میلیون سال پیش می زیسته است - اگرچه برخی خلاف آن را می گویند. در هر صورت، این جد مشترک به این معنی است که بخش بزرگی از ترکیب ژنتیکی ما شبیه سایر پستانداران، به ویژه شامپانزه ها است که تا 99 درصد از DNA ما را به اشتراک می گذارند. با مقایسه DNA انسان و سایر حیوانات، محققان می توانند متوجه شوند که انسان چه زمانی و چگونه از سایر گونه ها فاصله گرفته است. اما یک ژنوم مهره‌داران می‌تواند میلیاردها کاراکتر داشته باشد و محققان باید از ابزارهای مختلفی برای شکستن این ماده ژنتیکی قبل از اینکه آن را در یک تصویر کامل بسازند، استفاده کنند. در نتیجه، نقشه‌برداری از ژنوم‌ها از لحاظ تاریخی فرآیندی پر دردسر بوده است: با شروع سال 1990، محققان 13 سال طول کشید تا اولین طرح ژنتیکی را برای انسان ایجاد کنند. با این حال، فناوری نقشه برداری DNA برای گونه های مختلف در چند دهه گذشته به سرعت پیشرفت کرده است و این پروژه جدید گام دیگری را نشان می دهد و زمان توالی یابی را از سال ها و ماه ها به چند روز کاهش می دهد. برای انجام این کار، این تیم از تحقیقات دو پروژه استفاده کرد: پروژه ژنوم مهره‌داران و اطلس ژنوم مرجع اروپایی. از این طریق آنها الگوریتم‌ها و نرم‌افزارهای رایانه‌ای را برای جمع‌آوری بخش‌های ژنتیکی کوتاه در یک نقشه کامل ژنتیکی توسعه دادند و در نهایت آزمایش کردند که جریان کاری آنها چقدر ژنوم کامل یک فنچ گورخری (Taeniopygia guttata) را که قبلا منتشر شده بود، بازتولید می‌کند.